Hay muchas diferencias entre los dos. Tantos, de hecho, que literalmente estás comparando manzanas con naranjas.
La única similitud que puedo pensar entre los dos es que hay una diferencia de temperatura (un lado caliente y uno frío).
En el caso de un motor Carnot, solo se considera la relación de temperaturas en las zonas frías y calientes en el cálculo de la eficiencia del motor. Esta sería la mayor eficiencia posible que se puede obtener en un motor que funciona dentro de los límites de temperatura correspondientes. Esto no incluye las pérdidas debidas a la fricción, la presión, etc. El concepto del motor de carnot es un concepto de motor ideal.
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El efecto termoeléctrico es otra cosa. Cuando tiene dos cables conductores hechos de diferentes materiales conectados en los extremos y cada extremo se mantiene a una temperatura diferente, se configura una EMF (fuerza electromotriz, medida en voltios) a través de los cables entre las zonas fría y caliente. Esto se debe al movimiento de los electrones entre las zonas frías y calientes. Este concepto se usaría en termopares, generadores termoeléctricos que se denominan ATG (generadores termoeléctricos automotrices) cuando se usan en aplicaciones automotrices, etc. Básicamente, en cualquier lugar, el calor residual se puede convertir en energía eléctrica adicional.
Lo anterior describe brevemente qué es cada concepto. La única similitud que veo aquí es sacar energía de un sistema mantenido dentro de una temperatura fría y caliente. Una gran diferencia es la ausencia de piezas móviles en generadores termoeléctricos en comparación con los motores térmicos. Existen muchas otras diferencias en el funcionamiento mismo de los sistemas que pueden deducirse de las breves descripciones mencionadas anteriormente.
Comentarios y sugerencias son bienvenidas…