En resumen: Bamboo tiene una mejor experiencia de usuario, tiene soporte y pasa por el control de calidad.
Jenkins es de código abierto, lo cual es bueno, pero la competencia central de su empresa es otra cosa, de lo contrario estaría utilizando su propio producto.
Una cosa realmente buena de Jenkins es que los archivos de configuración de compilación están en el disco, lo que facilita la clonación y reconfiguración masiva de compilaciones.
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Volviendo a Bamboo, si compra la edición empresarial, también obtiene el código. He solucionado y reportado problemas a Atlassian en algunas ocasiones.
Una última nota: ejecutamos Gerrit y Jenkins para la primera fase de nuestro sistema de compilación, y una vez que se integra el código, ejecutamos Bamboo para todas nuestras pruebas de integración completas y lanzamos compilaciones. Cada vez que tengo que trabajar con Jenkins me estremezco.
(Disculpas por la calidad de la publicación. Escrito en iPhone)